مؤسسه تحقیقات ثبت و گواهي بذر و نهال بر اساس ماده دوم قانون ثبت ارقام گیاهی و کنترل و گواهی بذر و نهال مصوب 1382/04/29 مجلس شورای اسلامی به منظور شناسایی و ثبت ارقام گیاهی و کنترل و گواهی بذر و نهال تشکیل شده است. و زیر نظر هیأت امنای سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی به عنوان مهمترین رکن آن قرار دارد.
مهمترین وظایف این موسسه عبارتند از:
1- ساماندهی امر کنترل و گواهی بذر و نهال جهت نیل به تولید و عرضه بذر و نهال با کیفیت و سالم.
2- اعطای حقوق مالکیت معنوی به به نژادگران ارقام جدید گیاهی.
3- حفاظت از منافع ملی از طریق شناسائی ذخائر توارثی گیاهی کشور و ثبت آنها به نام دولت جمهوری اسلامی ایران.
4- معرفی ارقام جدید گیاهی در فهرست ارقام ملی
5- تدوین و پیشنهاد استانداردهای ملی لازم و روزآمد در زمینه کیفیت و سلامت بذر و نهال.
6- نظارت دقیق و مستمر بر مزارع تولید بذر، باغهای مادری تولید پیوندك، کنترل و صدور گواهی اصالت ژنتیکی، سلامت
و کیفیت بذر و نهال تولیدی، صادراتی و وارداتی و صدور گواهی کیفیت جهت ترخیص از گمرکات کشور.
7- صدور مجوز تولید بذر و نهال برای اشخاص حقیقی و حقوقی واجد شرایط.
8- صدور مجوز کنترل و نظارت بذر و نهال برای اشخاص حقیقی و حقوقی واجد شرایط.
9- حفاظت و صیانت از ذخائر توارثی و ارقام ثبت شده گیاهی در داخل و خارج از کشور.
10- ارائه نظر کارشناسی به محاکم قضائی در زمینه دعاوی مربوط به بذر و نهال و ارقام گیاهی.